Растения могут заболеть как от воздействия неблагоприятных факторов среды (экстремальные температуры, высыхание или заболачивание, промышленные загрязнения и т.п.), так и вследствие заражения фитопатогенными организмами. Соответственно, болезни растений делятся на инфекционные и неинфекционные. Часто неблагоприятные факторы среды провоцируют инфекционное заражение: так, поврежденные злаки могут стать менее устойчивыми к плесневым грибкам, а ослабленные неправильным уходом растения – к вирусам.

В числе неинфекционных болезней наиболее распространенными являются те, которые обусловлены неоптимальным балансом питательных веществ в почве, особенно после пересадки. При недостатке азота листья белеют и отмирают, недостаток фосфора ослабляет рост побегов. Пожелтение листьев может быть вызвано недостатком кальция. Недостаток микроэлементов (железа, фосфора, цинка, меди, бора) вызывает специфические заболевания растений.

Довольно распространенной болезнью является побеление листьев у многих растений, культивируемых на известковых почвах. Избыток извести затрудняет впитывание железа корневой системой. В таких случаях железосодержащие подкормки корней бесполезны: помогает опрыскивание листьев специальными растворами, содержащими биологически активные соединения железа.

Заморозки и сильные зимние холода могут вызывать специфические повреждения: трещины, некрозы, полегание стеблей. Вследствие длительного воздействия чрезмерно низкой температуры растения могут «простудиться»: в холодной почве корневые волоски не могут с нормальной интенсивностью впитывать влагу,  и после долгих холодов даже прогревание почвы они не восстанавливает их функции.

Высокая температура и прямой солнечный свет, особенно при несвоевременном поливе, может вызвать ожоги листьев. Высокая влажность при высокой температуре понижает устойчивость всех нетропических растений к инфекционным заболеваниям, а в семенах нарушает нормальное протекание энзиматических реакций.

Воздействие промышленных загрязнений – токсичных газов, загрязненных грунтовых вод и осадков – приводит к ожогам и разнообразным заболеваниям листьев, угнетает рост побегов, оказывает тератогенный эффект.

Инфекционные болезни вызываются воздействием патогенной микрофлоры. Это могут быть самые разнообразные возбудители: вирусы, плесневые грибки, бактерии, микоплазмы. Питание и размножение микроорганизмов не только вызывает характерные повреждения, но и служит причиной заражения ближайших растений. Узкоспециализированные возбудители поражают только один вид растений, неспецифические – многие садовые и сельскохозяйственные культуры. Устойчивость к распространенным заболеваниям может широко различаться у разных сортов одного вида.

С растениями связано более 600 видов вирусов. Это внутриклеточные паразиты, состоящие из молекулы нуклеиновой кислоты и белковой оболочки. Вирусное заражение развивается как следствие механического повреждения листа (в том числе после заморозков и укусов насекомых-вредителей) или в потомках зараженного посадочного материала. Чаще всего вирусы нарушают синтез хлорофилла, поэтому на больных растениях появляются белые пятна, мозаичность, крапчатость. Иногда листья и побеги сильно деформируются.

Микоплазмы – небольшие амебоподобные микроорганизмы размером до 1 мкм. Они содержат и ДНК, и РНК, но при этом не могут размножаться вне клетки организма-хозяина. Характерными признаками микоплазмоза у растений служит мелколистность, резко сниженная продуктивность и угнетение роста.

Бактерии размножаются делением, а в неблагоприятных условиях образуют устойчивые споры. Бактерии значительно крупнее вирусов и микоплазм (0,5 – 5 мкм), но при этом мельче растительных клеток. Бактериальное заражение происходит через устьица или нектарники, при механических повреждениях листьев и корней. Помимо патогенного воздействия самих бактерий, болезнь также может развиваться вследствие воздействия бактериальных токсинов или дисбаланса ферментативных реакций. Заражение от других растений происходит с водой, с помощью  насекомых-опылителей, через садовые инструменты или при непосредственном контакте.

Не менее 80 инфекционных болезней у растений вызываются грибковыми инфекциями, аскомицетными или базидиомицетными. Зараженные растения покрываются плесенью или внутри растительной ткани развивается нитевидная грибница. У высших грибов мицелий многоклеточный. Практически все инфекционные грибки формируют споры или склероции, способные переживать достаточно сильные неблагоприятные факторы среды (высыхание, воздействие химических агентов).

Грибковая инфекция передается через споры по воздуху, с водой, дождем, насекомыми, через семена, зараженную почву или садовые инструменты.

Для профилактики инфекционных болезней растения нужно защищать от механических повреждений, кустарники и деревья после обрезки смазывать в местах срезов дезинфицирующими смолами. Нельзя допускать переувлажнения и заболачивания грунта. После любых манипуляций с больными растениями садовые перчатки и инструменты нужно вымыть и продезинфицировать перекисью водорода, раствором борной кислоты или марганцовокислого калия. Луковицы и семена, не обработанные заранее производителем, перед посадкой протравливают дезинфицирующими веществами.